برخلاف پارااکسوناز ۱، پارااکسوناز ۲ و ۳ فعالیت پارااکسونازی و آریل استرازی محدودتری دارند و بیشتر دارای نقش آنتی اکسیدانی هستند و اکسیداسیون داخل سلولی را کاهش می دهند. پارااکسوناز ۲ یک آنزیم درون سلولی است و اکسیداسیون LDLرا در سلول کاهش می دهد. پارااکسوناز ۳ کمتر از پارااکسوناز ۱ با HDL سرمی ارتباط دارد. mRNA آنزیم PON3 عمدتا در کبد و کمتر در کلیه بیان می شود. mRNA آنزیمPON1 در کبد بیان می شود. در حالی که mRNA آنزیم PON2 در بافت های مختلفی بیان می شود. سنجش غلظت این آنزیم ها در بیماری های مختلف نظیر: آرتریت روماتوئید، هایپرتیروئیدیسم، اوتیسم، آلزایمر، اورمی، آترواسکلروز، بیماری عروق کرونر، انواع دیابت، مصرف سیگار، هیپرلیپیدمی، بیماری های کبدی و کلیوی، ارزش تشخیصی دارد.